Более шести веков назад, когда люди только искали себя в этом мире, они относились к покемонам иначе. Людская раса считала, что удивительные создания, окружающие их, являются ключами к познанию природы. Тогда человечество не ловило покемонов, а жило с ними в мире и сотрудничестве. Они строили города, в которых жили бок обок, занимались хозяйством, открывали новые земли. От долгого общения раскрылся потенциал чудесных созданий, а с ним и боевая мощь. Влиятельные люди начали призывать покемонов к военному делу, мудрецы к философии, и всё в этом роде. Это был большой прорыв, как для одних, так и для других, от чего человечество совершило невероятный скачок в развитии. Сформировалась власть, появились первые академии. Большой вклад в это внес клан Ноягама, связавший свою судьбу с учениями у покемонов. Семнадцать потомков семьи учились у легендарных покемонов, познавая стихии. Полученные знания клан Ноягама передавал людям в своей академии. Они стали великими учителями, и были уважаемы всеми живущими на территории нынешней Японии. Каждый из них имел своего партнёра - потомка от покемона, и верного друга их прапрадеда - Иви. С годами, углубляясь в тайны своих стихий, члены клана эволюционировали своих покемонов, и стали первыми тренерами. Ноягамы и их покемоны боролись с ворами и убийцами, оказывая помощь своим покровителям, но единственные, кому члены клана были верны - их наставники-покемоны. Года шли, и в один день легендарные покемоны решили, что больше не имеют таких знаний, которые могли бы передать своим ученикам. Тогда клан Ноягама вернулся в академию, и смог больше времени уделять своим протеже.
Одним из лучших учеников Великих Мастеров стал брошенный на произвол судьбы мальчик, которого нашли в лесу, и воспитали в самой академии - Ягами. Он был невероятно талантлив и любознателен. Познавая стихию за стихией, парень перенял все учения своих учителей, и отправился за лучшей жизнью. Проявив себя перед Императором, молодой Ягами стал его генералом. Передавая полученные в академии знания своим солдатам, он создал самую сильную армию, за что был избран женихом дочери своего господина. Когда Император покинул этот мир, власть перешла к Ягами. Он пытался поддерживать порядок в Империи, но с годами это становилось всё сложнее. Тогда-то он и понял, что для безопасности своих людей, Император обязан завладеть легендарными покемонами. Его рассуждения были затуманены гордыней и властью, но, всё же, в них оставалась капля здравого смысла. Страх, что все его труды канут влету, вынудил Ягами собрать поход, и завладеть легендарными покемонами. Слух об этом разбежался по всей земле, и не прошёл мимо Великих Мастеров. Учителя Императора взывали его к разуму, но ученик отказывался слушать их. Началась великая битва, в которой не было победителей - смерть забрала всех, оставив Иви без своих тренеров.
Арцедус, ставший свидетелем благородного поступка Великих Мастеров, не мог позволить мудрости своих защитников уйти вместе с ними. Бог подарил покемонам, что дрались за его свободу, иммунитет от кандалов времени, сделав их бессмертными. Но на этом его роль ещё не была сыграна до конца. Арцедус разделил людей и покемонов, веля им жить отдельно друг от друга: он забрал у человечества дар понимать чудесных созданий, стёр все оставленные на письменах учения Великих Мастеров, чтобы никто не смог использовал это во зло. Бог сказал, - "Отныне и на веки вечные, люди и покемоны будут жить раздельно, своими кланами. Их миры будут тесно связаны, но лишь уважение друг к другу позволит им сойтись вновь". С тех пор легендарные покемоны скрываются от людей, человечество не понимает язык созданий, и только тренеры могут восстановить былой альянс. Что же касается покемонов Великих Мастеров, так они до сих пор живут среди нас, и когда миру грозит опасность, все семнадцать Иви находят потомка своего первого тренера, дабы ещё раз совершить подвиг первых тренеров.